針對國內也難以妥善解決的漁業調整問題，日本水產廳正在與其海域相鄰的第三方進行協商。為順應全球趨勢，日本於1977年劃設200海里專屬經濟海域。同時透過與南韓及中國簽訂「日韓漁業協定」及「日中漁業協定」，以及與無邦交的臺灣簽訂「臺日民間漁業協議」，以維持漁業秩序。

然而，目前日韓間就南韓漁船佔據日本海暫定水域漁場問題，以及日中間就中國漁船非法於大和堆周邊水域作業問題，仍有歧見。在此情勢下，這些雙邊漁業共同委員會已久未召開。

然而，隨著日本近年來加強資源管理，必須與使用共享資源的周邊各方進行資源管理的協調與合作。日本亦持續呼籲韓中兩國進行協商。今年5月底，日本與中國在上海舉行久違的雙邊交流，雙方重申就資源管理協調與合作之重要性。

水產廳官員表示，為維護日本漁業從業者的成果，有必要在與周邊國家/地區對資源管理具備共識的基礎上，推動協調與合作。同時也強調，議題並非僅限於資源管理，在各項協定（議）所涵蓋的水域中，如何保障日本漁船的作業機會與安全航行，也是不可忽視的重要課題。

日台間簽署的「台日民間漁業協議」於今年一月進行協商，睽違六年檢討作業規則，並明確訂定措施，以抑制台灣漁具流入日本漁船作業海域的問題。